微生物细胞工厂

微生物细胞工厂

(1)合成途径工程(理性设计)
    面向大肠杆菌、扭脱甲基杆菌等底盘微生物,理性设计、组装、平衡外源合成途径。本课题组关注的途径包括:色氨酸合成途径((双吲哚、紫色杆菌素、蝴蝶霉素等)、萜类合成途径(异戊二烯、倍半萜等)以及吲哚萜合成途径(文多灵、长春碱、长春新碱等)


(2)定向进化育种(非理性改造)
    非理性手段仍然是构建、改造细胞工厂的强有力工具。其核心在于通过非理性手段构建细胞工厂表型多样性库,进而通过高通量筛选、适应性进化等手段获取目的表型。本课题组致力于以下三个方面的工作:
1)多样性突变库构建:利用常压室温等离子体(ARTP)微生物诱变、生物非严谨复制等手段构建多样性表型库;
2)高通量筛选模型与设备:基于生物传感器(转录因子、核开关、转录回路)的高通量筛选模型,开发单细胞水平、单液滴水平微流控高通量筛选设备;
3)进化育种:以适应性进化理论为指导,构建目标表型进化回路,高效获取目的表型。

(3)系统生物学分析平台
    尽力比较基因组、转录组、蛋白组、代谢组分析平台,为细胞工厂的改造提供数据支撑。

特色工作:
(1)常压室温等离子体(ARTP)生物育种
(2)级联代谢酶空间靠近效应
(3)生物传感器

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